自从离开了第五舰队之后，斯普鲁恩斯就没有以往那么好的运气了。就算金上将仍然很支持他，而且尼米兹也通过在军队与政府内部的关系为他提供了帮助，可是在回到了诺福克之后，斯普鲁恩斯就一直在处理那些他最不愿意遇到的麻烦，比如针对大西洋舰队作战行动的调查工作。
圣地亚哥沦陷之后，美军内部的矛盾全面爆发了，而矛盾的焦点就是由谁来承担这个责任。
金上将是肯定不会承认是因为舰队没有积极行动，才导致圣地亚哥沦陷的，毕竟舰队只是次要力量，而真正负责防御圣地亚哥的是陆军部队，而不是海军。可问题是，马歇尔也不愿意承担责任，甚至不愿意让布雷德利来背这个黑锅，因为当时马歇尔找不到一个可以顶替布雷德利的将领了。
在陆军总参谋部提交给总统的战报中，有意的避开了陆军所应该承担的责任，反而将海军在战役中的消极表现放到了首位，这其中，就以大西洋舰队的消极行动最为重要。当然，不能否认大西洋舰队的消极行动产生了影响，可是金上将绝不会承认这一点，而且他的观点有一定的证据支持，比如正是因为大西洋舰队的积极行动，唐帝国海军的主力舰队才无法在战役初期为登陆部队提供支持，不然圣地亚哥会更快沦陷，而没有守住圣地亚哥，是因为陆军的反击不够强大，而且布雷德利在战役之前的判断出现了根本性的错误。至于当时圣地亚哥港的海军部队在战斗中的表现，这个并不是关键，因为那不是作战部队，只是负责管理港口，以及维持港口正常运转的一支非战斗性部队而已。
之前，美国陆海两军的统帅还没有发生过直接争吵，而且在一些关键问题上，马歇尔与金一直保持着默契，比如在新奥尔良遭到轰炸之后，总统要求发动一次报复性反击行动，马歇尔与金都不支持，结果阿诺德也没有做出什么文章来。可是这次事关谁来承担责任的问题，不管是马歇尔，还是金，两人都不想因此而受到责难，更不想让自己的部下来背黑锅，自然就都不会让步了。
事情从八月中旬闹到了下旬，总统甚至为此专门召开了一次军队高层会议，可结果马歇尔与金上将都不肯让步。闹到最后的结果是，总统也不耐烦了。说白了，必须要有人出来承担责任，而且绝不会是马歇尔或者金本人，而是负责指挥部队作战的将领。那么，也就只两个人有可能背黑锅，一个是古巴防御司令布雷德利，另外一个就是大西洋舰队总参谋长斯普鲁恩斯。
可问题是，当时马歇尔全力担保布雷德利，而金上将又权利担保斯普鲁恩斯，而且都指责对方作战不力，才导致圣地亚哥迅速沦陷，而且都认为，如果对方能够更积极主动一点，或者是对战局的把握更准确一点，就不会遭受如此惨败。毫无疑问，这种争执是没有任何好处的，特别是当美军总司令（总统）是一个不折不扣的强硬派的时候，陆军总参谋长与海军部长的争执绝不会有任何好的结果。
当时，美国总统德拉诺刚刚开始他的第四界任期，他是美国历史上唯一一个连任四界的总统。虽然美国国内大部分民众在受到了欺骗性的宣传之后，都对战争充满了希望，但是作为一个已经连任四界，而且需要更多人支持的总统，也就是美军总司令来说，军队内部的任何争吵都是没有好处的，不管是马歇尔，还是金有道理，这种争执绝对要制止，也绝对要打压下去。
八月二十二日，总统给了陆军总参谋长与海军部长一人一巴掌。当天就成立了一个独立调查委员会，并且直接由白宫领导，不通过国务卿的内阁，也不受两军影响，而加入该调查委员会的都是总统幕僚班子里的权势人物。该调查委员会的任务就是查清楚到底是谁的错误指挥，以及消极态度最终导致圣地亚哥迅速沦陷。
因为当时古巴战场上的战斗还没有平息下来，唐帝国陆战队正在猛攻巴亚莫与奥尔金，在马歇尔全力担保，以及提出临战换帅对作战严重不利之后，调查工作就首先从刚返回诺福克没有几天的大西洋舰队开始。而参与调查的人员都是总统的亲信，并且获得了总统的最高授权，还有一支宪兵部队配合进行调查。也就是说，该调查委员会有权力传讯包括斯普鲁恩斯在内的大西洋舰队的任何一名官兵，并且进行隔离询问，而不需要接受金上将的干预。
金上将对此表示了强烈的不满，可是再不满，他也无法改变总统的决定。该委员会的调查小组在八月二十二日下午就到达了诺福克，并且在当天就将舰队司令部的参谋军官首先隔离了起来，然后是各战舰舰长，在后方负责联络的参谋军官。到二十三日上午，斯普鲁恩斯也受到了传讯。调查工作全面开始了。
不管这次调查的结果如何，对斯普鲁恩斯，大西洋舰队，甚至是美国海军而言，这绝对是一次巨大的打击。首先这让很多人意识到，总统不再信任海军。其次，调查工作严重的影响到了大西洋舰队的正常秩序。最后，这还严重分裂了大西洋舰队，给部分有野心的参谋提供了表现的机会。特别是在传讯了之前被斯普鲁恩斯解除了职务的那几名“谋反”的参谋之后，大西洋舰队内部已经四分五裂，而且人心惶惶，还有哪个官兵会想到作战行动呢？
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连续好几天，斯普鲁恩斯都在接受各种各样的询问。除了他心底要保全大西洋舰队的想法之外，他没有隐瞒什么，而且也没有必要隐瞒什么。说实话，当时负责调查的那几个人都不是海军军官，对海军又有多少了解呢？而且斯普鲁恩斯在指挥舰队作战的时候，就已经考虑到会遭到调查，因此他在下达命令，部署作战任务的时候都相当主意措词。可是斯普鲁恩斯忽略了一个问题，那就是大西洋舰队不是他之前的第五舰队，他的大部分亲信参谋都没有在这里，那么就不是所有的参谋都会站在他这一边。