打赢了浅红道馆，小智等人继续着他们的旅行。
途中他们经过了神奇宝贝保护区，认识了在那里生活的拉拉美族的富子，还参加了拉拉美族的庆典活动，神奇宝贝竞速赛，虽然火箭队的捣乱使得富子受伤不能参赛，但在小智的帮助下还是顺利的赢得了冠军，富子的小火马也在比赛最后关头进化成了烈焰马。
告别了拉拉美族，小智一行人继续前进，今天，他们终于到了期盼已久的地方，野生原野区。
“好兴奋，马上就到原野区了，想要收服神奇宝贝的心停不下来啊！”“这次有我在，可不能只捉30只肯泰罗就走了…”小智边走边说着，双手握拳兴奋的不得了，当然后面那句话是心里想的了。
小霞和小刚也兴致勃勃，似乎也要“大干一场”的样子。
一行人没有多远，就来到了原野区的入口，原以为会是人潮攒动，没想到连人影都不见，建筑也显得陈旧不堪，像是荒废了许久似的。
“怎么是这个样子，原野区不会是关张了吧，还是我们走错地方了…”小霞看着眼前破败的景象，一脸嫌弃的说道，失望之情溢于言表。
“小霞，放心吧，这里就是原野区，只不过因为某些原因导致了目前的状况！”小智倒是信心满满，毫不在意眼前的景象，径直走进了这个看似老旧的院子。（毕竟知道了剧情的发展…）
小智他们来到了一幢房子前，旁边是一扇大门，牌子上写着“神奇宝贝野生原野区”。小智敲了一下门，接着一个年纪看起来很大却很有精神的人开了门。
“我是神奇宝贝野生原野区的管理人，我叫凯撒，有什么事吗？”那人问道。
“你好，凯撒先生。我们想进去野生原野区捕捉神奇宝贝。”小智说道。
“这样啊，那就跟我进来吧。”凯撒说道，语气很是冷淡。
小智他们走了进去，当小智伸手拿那30个原野区的狩猎球和钓竿的时候。只见凯撒先生拿猎枪对着小智：“先说好，在这里只能使用我们原野区的神奇宝贝球和钓竿，用别的神奇宝贝球的话别怪我雷霆兄弟不客气。”
小霞和小刚下了一跳，小智也冷汗直流，尽管知道这家伙有枪，但是真正被枪口指着的时候还真是害怕…整理了一下情绪，小智镇定的说道：“知道了，我们不会不懂规矩的。”说着，一行人拿上自己的装备急匆匆的离开了凯撒的房子，出门之前，小智回头看了一眼那张挂在墙上的迷你龙照片，若有所思的笑了笑。
跑出房子后，小霞长舒了一口气，看来是被吓了一跳，“什么嘛，那个老爷爷脾气好坏，我们是顾客哎，又不是什么盗猎者，用不着拿枪指着我们吧…”缓过劲儿来的小霞开始埋怨起来。
小智和小刚一脸的无奈，不过小智还是站出来向众人解释。原来早先的原野区风靡一时，每天都有很多人来光顾，直到有一天有传言说原野区发现了传说中的神奇宝贝迷你龙的身影，引得更多的人来原野区捕捉神奇宝贝，原野区的环境也被搞得一团糟，导致原野区不得不暂时关闭，当然，迷你龙和凯撒先生的事小智还是隐瞒了下来…小霞和小刚听到后也明白了其中的缘由。
小插曲过后，一行人开始分头行动，寻找着自己中意的神奇宝贝。
“走吧，皮卡丘，看看我们能遇到什么神奇宝贝吧！”小智依旧兴致勃勃，跟皮卡丘悠闲地走进了原野区。
就在小智等人进入原野区的时候，火箭队也悄悄地遛了进去，不知道又在计划着什么。
没有多久，一片草地映入眼帘，很多野生神奇宝贝在草地上玩耍。小智撸起袖子准备大干一场，不断地扔出狩猎球，一场收服大战开始了。
没有了肯泰罗的干扰，收服进展的非常顺利，铁甲犀牛，飞天螳螂，尼多娜，卡蒂狗，凯西，伊布×8（主要是为了凑够进化型），当然也少不了肯泰罗，原野球用了近一半，小智开始转移现场，朝着龙之谷走去。
走进龙之谷，小智还是蛮纠结的，迷你龙是很想要啦，但还是尊重它自己的选择，毕竟它和凯撒先生还是有感情的。
走到一处池塘边，小智开始垂钓，心想即使钓不到迷你龙，钓到其他水系神奇宝贝也不错。
不一会儿，一只海刺龙就上钩了，小智毫不客气的收服了，不过之后一段时间都没有神奇宝贝上钩，小智有点无聊的打起了哈欠。
“哎，难道主角光环失效了？不应该啊。”小智等的有点不耐烦了，开始自言自语的嘟囔着。
就在这时，一只蓝白相间的神奇宝贝出现在水面上，功夫不负有心人，迷你龙终于出场了。
正当小智打算收服的时候，手中的狩猎球又放下了，“还是先跟它搞好关系吧，要不然一会儿它老妈出来还不把我杀了…”想起还有一只哈克龙在，小智决定用套路收服。
小智拿出事先准备好的食物喂给迷你龙，刚开始迷你龙还有些害怕，不过到底是个孩子，也在皮卡丘的推动下，不一会儿就和小智玩了起来，正当小智准备收服的时候，一声巨响打破了平静，迷你龙受到惊吓，一头钻进了水池里，不一会儿又冒出头来，在水面上疑惑的看着。
小智这会儿肠子都悔青了，怎么就没想到这帮家伙也会出现呢，果然是夜长梦多啊…“喂喂喂，你们有完没完啊。”小智一脸无奈的说到。
“既然你们诚心诚意的发问，普通人是不会回答的，我们就特别破例回答吧”
“为了防止地球被破坏，为了保护世界的和平”
“贯彻爱与诚实的邪恶，漂亮又诙谐的反派角色”
“亚马多，小三郎”
“穿梭于银河之间的火箭队的二人组”
“鲜艳的红色，桃色的明天等着我们。”
“对哦，这次来的不是火箭队三人组了，他们了虽然抢夺神奇宝贝，但是起码不会用枪，这两位可就说不准了，可恶，被摆了一道。”小智突然想起接下来的剧情。
火箭队的出现吓跑了迷你龙，巨大的声响也引起了小霞他们的注意，纷纷跑过来想知道发生了什么，“火箭队？居然不是武藏他们，你们几个又是谁！哎？！那个是？迷你龙！”看到火箭队的出现，小霞惊讶的说到，同时也注意到了水面上的迷你龙。
“哦？看来你们跟武藏和小次郎的小队交过手，那两个废物不堪一击，一直是我们的手下败将。”亚麻多一边嘲讽，一边指挥着小三郎。
说着，小三郎拿出一个火箭筒样子的东西，将一个巨大的网子发射出去，将迷你龙抓了起来。迷你龙奋力地挣扎着，奈何火箭队的网子经过特别处理，没那么容易挣脱，只得不停的呼唤着什么。
“哈哈，没有用的，我们制作的网子可是非常坚固的呦！”亚麻多在一旁笑着说。
正当小智准备派出神奇宝贝应战的时候，池塘里突然狂风大作，一个蓝色的身影冲出水面，有些愤怒的鸣叫着。