在海边度假的小智一行人，偶然间收到了一张邀请函，为了赶到派对的举办地新岛，小智一行人赶到枯叶镇乘坐渡轮，但是由于恶劣的天气，港口被封闭了。但是身为神奇宝贝训练家的小智等人，还是趁码头管理员不注意，派出自己的神奇宝贝，冲入了暴风雨中。
过了不知多久，小智他们终于冲过了暴风雨，来到了平静的风暴内部。
“这...你们看到了吗？”看到眼前平静的镜像，小霞难以置信的说道。不同于外面的****，飓风的中心平静异常。快龙和暴鲤龙也缓缓放慢速度，惊讶的看着周围的景色。
“好了，既然已经来了，大家就上岛吧。那边刚好有亮光，我们就过去吧。”小智四处环视着，看着不远处的灯火，决定前去登岛。
一行人来到灯火跟前，只间之前邀请函上的女仆正提着一盏古朴的油灯在岸边等候，看到小智等人到来，便迎了上来，“欢迎各位的到来，请您出示邀请函。”说着，小智掏出来之前的邀请函。
小刚一脸怀疑的看着眼前的女仆，突然发现了什么。“我就知道，原来真的是你，你是枯叶市的乔伊小姐。我就觉得你眼熟。”小刚兴奋的说道。小霞也仔细端详起来，也逐渐认同了小刚的想法。
听到小刚的称呼，女仆的表情出现了一丝异样，仿佛想起了什么，但是瞬间有恢复了之前机械的模样。“我不明白您在说什么，我从一开始就是这座神奇宝贝城的仆人，请各位跟我来。其他受邀者已经到来。”说罢，女仆便领着三人进入了古堡。而在另一边，关都地区的世界初始之树，一只粉色的神奇宝贝好像感受到了环境的变化，从沉睡中醒来，朝着新岛的方向飞来。
在女仆的带领下，小智一行人来到古堡的内部，伴随大门的缓缓打开，一个巨大的螺旋状雕塑出现在眼前，后面空旷的大厅内，率先赶到的三位训练家正围坐在大厅中央的桌子旁。
“这就是我刚才提到的受邀者。”女仆缓缓的解释着。
“等等，就他们三个？刚才在枯叶市可是有几十个训练家吧。”小霞疑惑的问道。
“如果没能力穿过暴风雨，那么他们也不配收到邀请。那个暴风正是对你们的测试。只有你们六位来到了这里，你们就是别选中的训练家。请把宝贝球里的神奇宝贝都放出来吧，派对马上开始了。”女仆头也不回的说着，身后的大门也缓缓关闭。小智则留了个心眼，嘱咐小霞和小刚暂时不要将神奇宝贝放出来，二人虽有些疑惑，但还是信任小智。
来到大厅里，训练家们的神奇宝贝都在活跃的打着招呼，小智也来到桌子旁和其他训练家打着招呼。大家纷纷谈论着自己怎么穿过暴风，一个叫做空男的训练家夸赞着自己的比雕，说它是怎么征服暴风雨的。另一个叫做海男的训练家则是乘坐暴鲤龙赶来的，身后的水系神奇宝贝也引来小霞的注意，最后一个女性训练家叫做小甜，它是乘坐水系神奇宝贝白海狮赶到的这里。
小甜美丽的外表也是征服了小刚，只见他一个健步冲了上去，夸张的展现着自己爱慕，结果还是被小霞薅着耳朵带走了，也引来了众人的哄笑。
就在一行人热闹的聊天时，大厅内突然灯光熄灭，螺旋状雕塑中间亮起一道光柱，“再次感谢各位的到来，下面我向大家介绍，世界上最强的神奇宝贝训练家，现在将加入你们的派对。”女仆从黑暗中出现，缓缓的说着。在场的训练家和神奇宝贝都紧绷着神经，看着眼前的光柱。
这时，一只紫色的神奇宝贝从顶部缓缓下落，大厅里的神奇宝贝们都警戒起来，似乎感受到了来自它的巨大压力，超梦华丽的登场了。
“我的主人不仅是最强大的神奇宝贝训练家，也是现存最强大的神奇宝贝，超梦。”随着主角上场，大厅的灯光重新恢复了，一旁的女仆走到众人跟前介绍着。
“超梦！好久不见！看来你最近的经历没有让你收获到想要的结果。”小智站在一旁，在心里对超梦说道，他知道超梦一定能听到他的声音。
“我记得你，小智，这些天的经历让我对人类赶到失望，我今天就要改变这个世界。”超梦冰冷的声音传来，小智无奈的摇了摇头，看来剧情就回到原点了，超梦的逆袭开始了
“胡闹！身为神奇宝贝怎么可能成为训练家！这不可能！如果这是恶作剧，那我现在就要离开了。”海男不敢相信眼前的一切，愤怒的说道。
“你确定么？”超梦低沉的声音透过女仆的口中穿出，让在场的人十分惊讶。才意识到眼前的神奇宝贝可以使用心灵感应来对话。随后，超梦抬手使出超能力控制住了想要离开的海男，将他摔入了大厅的喷泉中。
“可恶！暴鲤龙！破坏死光！”海男在喷泉中狼狈的爬出，恶狠狠的看着超梦，随即下令反击。
暴鲤龙看到自己的训练家被攻击，十分气愤的使出了破坏死光，巨大的黄色光线冲向超梦，但它只是轻轻的抬起了手，一个防护罩阻挡在它面前，任凭暴鲤龙怎么攻击，都无法突破防线。随后，超梦微微用力，破坏死光就被反弹回去，命中了暴鲤龙。仅一击就失去了战斗能力。
“就这种程度吗？你的攻击简直就是挠痒痒。至于你，已经没有利用价值了。”超梦嘲讽道，随后轻轻挥了挥手，接触了对女仆的控制。女仆摇摇晃晃的走着，小刚一把抱过，随着头上的围巾掉落，粉红色的头发露了出来，果然是乔伊。
“我这是在哪？我怎么会在这儿！”乔伊小姐醒了过来，疑惑的问道。
“我把你从神奇宝贝中心带来这里照料我，有一个了解神奇宝贝生理的专家，事情就方便多了。以我的能力，控制人脑是种很简单的事情。”超梦解释道。
“超梦！你不要太过分了！你这样做和火箭队那些家伙又有什么分别！”小智朝着超梦怒吼着，很是不认同它的话。超梦则是淡淡的看了他一眼，很是不在乎。
“我曾想和人类共同生活下去，但是经过这段时间所见，这个世界令我失望。人类是比神奇宝贝更低劣的生物，如果让人类这种弱小又自私的生物来支配世界，这颗星球迟早要完蛋。”超梦沉吟着。
“人类弱小又自私？难道支配世界的是神奇宝贝么？”小刚在一旁发问。
“不，神奇宝贝也不行，要是说为什么，因为这个世界长时间在人类的支配下已经变得破乱不堪，一直为人类服务的神奇宝贝自然也不行。”超梦轻蔑的环视在场的训练家们，轻蔑的说着。
听到这儿，小智肩上的皮卡丘跳了出来，愤怒的驳斥着超梦的话。
“哦？你是说你不是他的工具，你们是伙伴？幼稚的想法。”听到皮卡丘的反驳，超梦不屑的说到。说罢，超梦眼神一变，使出超能力将皮卡丘甩飞出去。小智飞身互助皮卡丘，重重的摔在地上。
“只有弱小的神奇宝贝才需要人类的保护，而我是这个世界上最强的生物。”超梦彻底被愤怒冲昏了头脑，现在的他已经听不进任何人的话里。
“说什么鬼话，只要是神奇宝贝就能够收服，去吧，铁甲犀牛！”空男不信邪，继续挑战超梦。铁甲犀牛重重踩踏着地面，冲向超梦。结果，超梦依旧轻轻抬起手，铁甲犀牛被无形的力量束缚在空中，随后被甩飞出去，再也没有站起来。