商毅的预计果然不错，双方就在关原这块狭小的地区内驻兵不动，互相对持，一直到八月二十日，都没有发生过什么大战。
幕府军的布阵是以南宫山为核心，布成一个三角阵，由酒井忠胜在南宫山顶驻下幕府军的本阵，汇同松江藩主松平纲隆、高松藩藩主松平赖常、小田原藩藩主稻叶正则等大名，兵力为十万六千；由尾张藩藩主徳川义直，甲府藩藩主德川纲重、岩槻藩藩主阿部定高为主，共计八万人马，在南宫山西面的桃配山下营，成为幕府军的箭头；由水户藩的藩主徳川光圀、大多喜藩藩主阿部正能领里六万五千，在南宫山的北面，横断中山道布阵，为右翼；由纪尹藩主德川赖宣、新田藩主阿部正春领军五万七千，在南宫山的南部，横列伊势街道下寨，为左翼。
双方的主阵相距大约有五、六千米左右的距离，而相距最近的各军，只有三千多米。也可以说几乎就是短兵相接了。
虽然和上一次关原合战相比，幕府军在地利上并不逊色于倒幕军，双方旗鼓相当。但这一次关原合战，双方参战的兵力和对持交战的时间，都大大超出。
上一次关原合战，双方头天晚上进入阵地，第二天开战，半天战斗就结束了。而在开战之前，西军出动了八万八千二百兵力，东军为七万九千九百兵力，而在开战之后，双方实际出战的兵力为：东军四万一千三百人，西军三万四千一百人。双方实际出战的兵力之少，主要是因为西军的大部份大名都按兵不动，而东军也要分出相当的兵力来防备他们突然参战。
而这一次关原合战，双方出动的兵力合计有五十万，从双方在关原分别布阵之后，到现在己经对持了十余天的时间，还不知要对持多久，
当然在对持的这段时间里，小规模的冲突战斗到也是发生过几起，但都是千人左右规模的战斗，双方互有胜负，幕府军主动是到倒幕军的大名一方动手，而中华军只出战过两次，基本也只是派出一个营的兵力出战。只是在八月十七日，双方发生了最大的一次战斗，各动了三千多人马，在战场中间的十九女池附近激战了一个多小时，不分胜负，后来中华军派出了一个营的兵力参战，幕府军立刻撤退，倒幕军一方到是占了一点便易。而随后的三天，双方并没有再发生过战斗。
但这样长期对持下去，对幕府军来说，现然是很不利的。因为幕府军的兵力是倒幕军的近一倍，而且补给线也要比倒幕军长得多，因此所消耗的粮食、物资要比倒幕军高出一倍有余。虽然说德川幕府经过五十年的积累，到也有一些家底，但这样旷日持久的对持，也耗不起。而虽然倒幕军的一方在经济实力不及幕府军，但由于在前一阶段的战斗中，连灭了十几个藩，从这些藩地获得了大量的物资，而且补给线短，物资运输上，可以走海路，快捷省力，因此在后勤供应方面，反到比幕府军好得多。
另外幕府军还有后顾之忧，北方的上杉刚宪和伊达纲宗虽然说暂时没什么声息了，伹很难说得准他们会有什么动作，因此留守江户的保科正之也不断写信给酒井忠胜，让他速战速决。
其实这些情况酒井忠胜也不是不知道，但他不敢轻易出战，也是有说不出的苦衷，虽然幕府军的兵力多，但他对中华军还是非常忌殚，因此希望先击败倒幕军的其他大名，然后再集中优势兵力，来对付中华军，但现在倒幕军的阵式布置非常严密，中华军分占南北两个高点，可以控制全局，幕府军进攻其他大名，势必会遭到中华军从两侧的打击。
而向两翼的中华军发动进动，酒井忠胜还没有那个胆量，毕竟他也带队参加过中原大战，知道一但等中华军布置好了防线之后，就很难攻破，更何况中华军还是在山上布阵，占据了绝对的优势地利。想要突破中华军的阵地，幕府军将会付出大量伤亡，现在幕府军的士气本来就不高，一但再遭遇重大伤亡，岂不是雪上加霜吗？因此酒井忠胜也十分纠结，左右为难。
当然酒井忠胜也并不是什么都不做，这一段时间以来，他一直都派岀小股兵力，去引诱倒幕军的大军出战，希望能将倒幕军引出中华军控制范围，再突然増加兵力，打几个胜仗，鼓舞一下士气，但倒幕军也十分谨慎，基本就是你来多少人，我出多少人，幕府军撤退，也决不穷追。而且到了战斗的关建时刻，中华军就出兵助战，这种山区密林，其实也非常适合中华军做战，因为幕府军很难发现中华军的行踪，什么时候摸到了战场来，突然就是一阵射击轰炸，因此也令幕府军几乎无机可趁。连打了好几仗，也没占到什么便易。