而另一批官员则正好相反，因为从元代以来，北京就是中国的首都，前后长达近四百年，其间只有朱元璋短暂的在南京建过都，因此中国的重心其实是在北方而不是南方，另外现在全国虽然己经统一了，但还有蒙古、青海、新疆等地都没有收回来，都有可能危胁到帝国的边境，而这些地方基本都集中在北方，相对来说，南方面临的外部危胁并不大，如果以北京为都，对些地方的控制和管理要便利一些。因此还是仍然应该以北京为首都，南京为陪都较好。
这两种意见确实都有道理，而且定都也确实是一件大事，无论是定在南京还是北京，都应该尽快确定下来。当然从人数上来说，主张定都南京的，肯定要大于定都北京。毕竟帝国在南京己经住了四五年，而且绝大多数官员都是南方人，因此当然都不希望到北京去。
不过在商毅心里，早就己经有了定论，首都还是应该在北京，南京仍然应该作为陪都。因为发展工商业、海外贸易这些事件，并不需要**时时刻刻盯着，只要制定好相应的制度，依律而行，尊照经规率来运行就可以了，**最多只是监督一下。相反如果**对经济管得太多了，并不一定就是好事。
而且商毅也淸楚，现在帝国真正面临的危胁仍然是在北方，至少在两百年內，中国在南方的沿海地区都不会遇到太大的危胁，而在北方有蒙古、青海、新疆包括东北外兴安岭、库页岛等这些地方要并入帝国的版图，因此定都在北京，确实有利于帝国能够更好的控制这些地区。
另外在更北的地方，还蹲着一头凶狠的北极熊，这头熊现在已经开始将利爪伸向了中国，在另一时空里，在不到四十年的时间里，中国就将和这头大熊进行一次正面的较量，而从此以后在长达三百余年的时间里，尽管中国和这头大熊有过一段短暂的蜜月期，但在绝大多数时间里，这头大熊始终都是中国最大的危胁。这些一来，定都北京，也确实有利于帝国看住这头北极熊。如果让商毅来和俄国谈［尼布楚条约］，是绝不会让出贝加尔湖以东，外兴安岭，尼布楚及东西伯利亚这大片的领土。
这些是外部因素，而从中国內部来说，中国的北方地区相对经济不发达，工商业基础差，思想也保守落后，因此也难以接受新的事物，社会改造的困难也要大一些。如果将首都设在北京，也有利于促进北方的社会生产改变。
于是商毅也招集内阁成员，将自己的考虑意见告诉给他们。
几位内阁成员中，基本都建南方人，不过在讨论国事上还是会顾全大局,因为商毅所说的几点意见都有道理,由其是北方的俄罗斯,也从欧州各国的使团那里得知,这确实是一个庞然大国,想一想从中国到欧州海路要走上九十个月,而俄罗斯竞然可以直接更恒在两地之间，也可见是何等庞大。由其是欧州各囯使臣都异口同声，称俄国人素来逞强好斗、凶残成性绝非善类。商毅把应付俄国的危胁也计算在其中，也算是有先见之明了。
因此等商毅说完之后，王夫之才道：“皇上见识卓著，诚为我等所不及，只是迁都之事，辗转数千里，伤筋动骨，劳民耗财，又事关社稷安急，国本安宁，利害重大，因此不可轻易实行，而且现在北京刚刚收复，地方未宁，人心未安，也不可急于一时。”
李岩也道：“王首辅所言极是，虽然迁都北京，利多而憋少，但现在我中华新立，国本不固，人心不定，四境不安，因此确实不可轻易行迁都之举。”
商毅点了点头，笑道：“两卿所言，果然都是老诚持重，端持为国之语，朕也以为，只可先定都北京，而迁都之举，在五年以内，不可行施行，等五年之后，再视那时的情况而定。”
王夫之和李岩听了，也齐声道：“皇上圣明。”
商毅又道：“不过朕打算在八九月间巡视北京，各位以为如何。”