有人欢喜就有人愁，商毅的这个新年过得非常愉快，但清廷却充满了杯催的气氛，整个新年里也都悲悲沉沉，如丧考仳一样。
谭泰、伊拜图、佟图赖、石廷柱等人率军回到北京之后，多尓衮立刻下令，命郑亲王济尔哈郎、英亲王阿济格率谭泰、佟图赖、领十万大军出关，收复辽东。伊拜图、石廷柱领五万人马，收复天津，驻守海边。
但等济尔哈郎、阿济格的大军，杀入辽东的时候，商家军早己从盛京撤军，但盛京地区的三大皇陵全部都遭到了极大的破坏，而且商家军撤离的时候，又放火将盛京全部烧毁，留给清军的，只是一片废墟。消息传来北京之后，朝野上下立时恸哭一片，不少人都哭得几度昏迷，死去活来。还有不少人都吵吵嚷嚷，要求清廷立刻出兵，和商家军决一死战，报此不共戴天之仇。
而清军接手的辽东，完全是一个乱摊子，商家军在辽东的时间虽然不长，但破坏力极大，除了盛京之外，还连毀了好几座州城，导致几十万人成为无家可归的流民，只好四外流窜，以抢夺求生。因此商家军虽然退了，但辽东依然不安定，清军还需要四处平定流民之乱，在短时间内，无法从辽东抽身。
而且多尔衮也知道，就算辽东安定下来，清廷也没有力量向商家军发动进攻，因为这时清廷已经收到了南京失守，多铎被擒，驻守南京的十几万大军全军覆没的消息。在这种情况下，商家军不乘机发动北伐，就已经是好的了。因此多尔衮一面严今将这股呼声强压了下去。一面又以皇帝福临的名议,下罪己诏。
随后多尔衮又得知，商家军在攻占了南京之后，正在占领江南的湖南、江西两地，并且和南明各朝廷发生了冲突，心里也大为放心，看来商家军还没有北伐的意图，而且如果商家军进一步和南明各朝廷发生恶交，说不定会把商毅的注意力吸引到南方去，这对清廷当然是一件好事。
但清廷下一步将做何打算，如果商毅真的和南明恶交，清廷是选择坐山观虎斗，还是出兵联合一方，而且引伸一下，清廷的最终目标，是满足于现在南北分治，还是仍然要统一天下，多尔衮现在也心里也没有一个准主意，论行军打仗，多尔衮确实不比皇太极差多少，但论大的战略眼光，高瞻远瞩，定策决断，多尔衮也不得不承认，自己拍马也赶不上皇太极。而且在这方面，满旗重臣也帮不上多尔衮多少忙，因此只能依靠汉臣。
多尔衮首先找范文程商议，而范文程建议，最好是先招回洪承畴，一来是了解一下前线俱体的情况，二来也是听一听洪承畴的想法。多尔衮也从其言，下旨招洪承畴回京面对。
就在这时，又传来消息，商毅在南京对清军进行公审，将六千多清军，连同多铎等十余名高级将领持行枪决，同时还在［杭州时报］上发表了一份充满了示威口气的发言，这个举行也让多尔衮大为震惊，同时也感到一阵心寒，一来是没想到商毅会这么狠，二来商毅这明白着是向清廷挑畔，表示他根本就没有把清廷当一回事，想杀就杀，丝毫不留情，就好像过去清军杀汉族人一样。
但问题在于现清廷根本无力向商毅发反击，而且就是有力量，多尔衮也不敢轻易向南方进攻了，如果多尔衮也能穿越一把，首先要做的，就是绝不再发动第二次南征了，只可惜没有后悔药吃，也只能这么忍着。而且也不禁老调重谈，商毅到底是从那里冒出来的人呢？为什么会这么厉害。
但想想过去二三十年里，清军一直都打得明军满地找牙，皇太极甚致口出狂言，清军对明军可以以一敌十，几曾遇到过现在的局面，因此在清廷之中，也开始出现种种流言，认为清军所以会惨败，完全都是因为多尔衮太无能，如果先帝还活着，这时早就己经统一天下了。
听到这些消言之后，多尔衮心里又气又悔又恨，他当然知道,这是政敌对自己的攻击,但碰上商毅这样的怪物，皇太极活着又能有什么用，结果恐怕还不如自己，要怪只能怪自已命不好，怎么遇到商毅这样一个对手，皇太极怎么就死得那么早，把个烂摊孑甩给了自己。
结果生气带憋火，同时又伤痛多铎惨死，多尔衮又一次病倒，在床上躺了十余天没起来。幸好这次济尔哈朗不在北京，要不然还真就危险了。
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洪承畴回到北京的时候，己经是正月初二，他的新年是在回京的路上过渡的。
当然现在洪承畴也无心过年，说实话这一路上洪承畴心里也颇为不安，也不知道自己这次进京的命运如何。不管怎么说，自已也是这次南征的主将，现在遭到这样的惨败，自己肯定是脱离不了付责的。
当然在回北京之前，通过种种手段，洪承畴终于迫使赵岳倔服投降，也算是最后有一点收获，在一路上洪承畴毎天都和李本深、赵岳讨论商家军的战术以及训练方法，一来是打发旅途时间，二来也是认真准备，进京之后应对多尔衮的种种对策。而每谈论一次，洪承畴也都自觉受益非浅，但自己准备的这些东西，能否打动多尔衮，洪承畴心里也没有底。