温克图看了看身边溃败回来的士兵，又看了看正在向自己逼近过来的穆陵军，终于明白，这一仗是彻底失败了。如果等穆陵军逼近过来，进入火枪的射程之内，自已恐怕也难以逃脫，因此也只得拔转马头，随着人潮一起败退了下去。
而这时进攻左翼的蒙古军本来就是在免强应付，一见中路的人马败了，那里还敢再继续支撑下去，也立刻就跟中路一起败退了。而进攻右翼的淸军虽然还十分顽强，依然和穆陵军杀得难分难解。但中路和左路的人马全都败退之后，这一路的清军再算顽强也是孤掌难鸣，因此只能也败退了下去。
就这样淸军终于全线溃败,四散逃开了。
就在这时，商毅也接到了在济南府里，被俘的百姓在赵从夫、吴汉生等人的组织下，成功的发动了暴动，以经打败了留守的清军，占领了济南府全城的消息。一见淸军全线溃败，也立刻下令，令穆陵军趁胜追击。同时命令留守在历城县里的两千青州府人马，让他们先期赶到济南府，去接收关城。
如果温克图没有收到济南府城中发生动乱的消息，他自然就会向济南府里败退。但现在温克图也明知道，济南府恐怕是守不住了，逃到济南府也是死路一条，因此也只能放弃济南，率领一部份人马，向西落荒败走。好在这时穆陵军也忙着接收济南府，也并没有苦追，只追击了一会儿之后，就收兵返回济南去了。
而清军一气跑出了二十余里，一直退到了齐河县附近，才算停住了脚步。这时温克图这才收陇残兵败将，并又派人到各处去招集其他的败兵，顺便还打听一下明军的动向。
在一天之后，终于聚陇了差不多有三千多人，同时也知道，济南府确实以经被明军攻占了。并且从几个济南城里逃出的清军口中得知了济南府内发生动乱的一些详细情况。
现在济南府是彻底丢了，而且以温克图目前的这一点兵力，想要复夺济南府等于是痴人说梦。但如果就这么到兖州府去见阿巴泰，温克图也知道，那肯定也是死路一条，非被阿巴泰杀了警告全军不可。但想要逃走，自已的家人却还都留在关外。因此温克图思来想去，最后终于决定，趁着阿巴泰还不知道济南丢了，冒险潜回关外，把家人接走，然后再远走高飞。于是就在当天夜里，温克图带着几个亲信，收拾了一些金银细软之物，又牵了十余匹马，连夜向北而去。
而第二天一早，其他的败兵忽然发现，自己的甲喇额真不见了，也都各自乱了起来，又等了一天，也不见温克图回来，也就都知道，他大概是跑了。于是也有人趁乱跑掉，不过大多数人还是决定，到兖州去向阿巴泰报信。但这么一耽搁，等阿巴泰收到济南失守的消息时，以经是十余天以后的事情了。
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打败了清军之后，商毅留下一部份人马打扫战场，带着另一部份人马也来到了济南，并且马上命人骑快马分别像青州府和登州府报捷。
但就在刚一进城的时候，又发生了一件商毅意想不到的事情。
原来清军在济南府中屯集了大量粮草物资，仅白银就有好几十万两、堆了好几间库房。赵从夫和吴汉生带领着百姓打跑了留守的清军之后，百姓们只顾杀清兵，抢食物，也还没顾得上其他，加上两人又对百姓加以安抚，因此城中还保持着比较好的秩序。
但就在两千青州兵进城之后，情况立刻就全变了。
这批青州兵别看打仗没有能耐，但干别的却是一套一套，进城一看，清军都跑光了，除了自己以外，再也没有别的人马，致于那些百姓，他们还沒放在心上。立刻就大胆了起来，分头在城里大肆搜找起来，清军屯集的物资本来也没有刻意隐藏，因此被他们毫不费力就找到了不少，一看城里原来有这么多好东西，那还客气什么，立刻就开抢起来。
一开始他们只是抢东西，但很快就有一部份青州兵把目光放到百姓们身上，说不定这群百姓身上还藏着不少好东西呢？同时还有被清军选出来的数千妇女，都在各自寻找亲人，虽然男女混杂，但也看得出女人不少。于是青州兵们也都动了坏心思，借口搜查，开始对百姓们吆五喝六，打骂申诉，拉拉扯扯起来。
如果是在平时，老百姓到也只能忍受，但这时百姓们刚刚打退了清军，身上的热血还没有平息下来，那些忍得了这个，双方立刻就发生了冲突，并且很快就打了起来。不过明军的战斗力和清兵相比，实在是差得太远了，因此被百姓们打得东倒西歪。这部份青州兵一见打不过百姓们，赶紧去找其他人来帮忙，而百姓们同样也有帮手，双方越聚越多，仗也越打越大。以经发展到了二三千人的混战。
而赵从夫、吴汉生等人只有几十人，济南这么大，根本就管不过来，等他们接到消息，赶到冲突现场的时候，双方以经打得不可开交了，不是他们这几十个人能拉得开的。幸好这时商毅以经带领着穆陵军进城，闻迅之后，也立刻赶到了现场。