木叶其他人的进步也都很大，这三年的时间大家都没有荒废。小樱继承了纲手的衣钵，除了精通医疗忍术外，学会了强大的怪力拳，中级层次的幻术。志乃的虫术也非常精熟，运用自如，牙和赤丸也已经能够自由施展牙狼牙和狂犬吠日这种高级的忍术了。雏田的柔拳进步也不小，而在太极上的进境超过了宁次。宁次则相反，在柔拳和八卦掌上稳稳压住雏田，但在太极的领悟上，却远不如雏田。八云的幻术突飞猛进，她现在用画板描绘攻击的速度，已经与结印发出忍术相差无几了。她的体术也有了很大进步。当然，八云依然是小组垫底，这是先天体质造成的，没办法弥补。
阿雪的感知能力和火遁忍术，都非常了得，已经是木叶最知名的感知忍者。梁襄的刀法一日千里，在卡卡西的帮助下，梁襄将白牙的刀法进行了改造，让这套刀法更适合自己，因为梁襄不具备旗木朔茂的一些强大能力。千夏的木遁忍术和剑法也都非常精熟了，火遁也能够正常使用了，大和功不可没。三年来大和付出了不少心血，将千夏培养成了强力的木遁忍者。猪鹿蝶三人组，也都有了长足的进步。井野的医疗术只比小樱稍差一点，鹿丸和丁次的家传忍术更加精进了，鹿丸能够自由使用影子，而丁次也可以将身体任意放大了。
小李的体术完全继承了阿凯的真传，但八门遁甲依然只能开到第五门。天天的忍具能力增长很多，功夫熊猫已经长大，与天天配合默契，弥补了天天近战能力不足的弱点。干笋的定位在辅助忍者上，他能够大幅度增强队友的战斗力，声音攻击和幻术攻击也都有了更多的进步，而且他的体术也没有放松，尤其是在速度上，仅次于小李，还在天天和宁次之上。
不过，干笋的近身战斗能力远不如小李和宁次，跟天天在同一个水平。宁次在太极上虽然进步一般，但却让他开了眼界，见识到了新的层次。笼中鸟的开启，让宁次完全脱离了束缚。日足已经将日向家的绝技，能够远程攻击的八卦空掌破例传授给了宁次。宁次的确是天才，在这帮伙伴中，是进步最快，也是最强的一个，至少表明上看是这个样子的。
三年的苦修，赤门学终于有了“长足”的进步，已经可以接受c级任务的委托了，神月出云和钢子铁都认为赤门学从实力上来讲，勉强具备了中忍的资格，但在其他方面，比如意志、精神层次等，依然是糟糕的不能再糟，临阵退缩是家常便饭。
月光疾风和卯月夕颜、阿斯玛和夕日红已经是木叶公认的两对情侣，疾风和夕颜都还年轻，想要再等几年再考虑婚事。而阿斯玛和红结婚的事情已经提上日程，打算等猿飞回到木叶，就举行婚礼。水木已经病死在监狱里，伊鲁卡和椿也开始正式交往，似乎木叶又要出现一对令人羡慕的情侣。这些事情，都是八云和雏田给晶臧的信里提到的。
这三年，大蛇丸也没闲着，领着手下那帮稀奇古怪的人，三次入侵云隐，意图染指完美人柱力。第一次入侵只是试探，前文已经提过。在第二次入侵时，大蛇丸在雷之国的山涧投了剧毒，让整个雷之国都陷入瘟疫恐慌中。大蛇丸的这种毒药，就如同欧阳锋的蛇毒一样，流毒无穷，但实际上并没有那么可怕，也不可能将所有的水源都污染，而且随着水的流动，毒性也会减弱。但在当时，却给雷之国和云隐造成了巨大的损坏，恐慌、骚乱、暴动，一时间遍布整个雷之国。这次入侵中，雷影和奇拉比兄弟联手，又使用了云隐的宝具才将大蛇丸挡了回去，但云隐损失极大。
第三次入侵时，大蛇丸使用秽土转生，召唤出许多千奇百怪的忍者，又用了不少禁术，差一点就将毛毛躁躁的奇拉比给抓走，多亏了云隐的一些精英忍者拼死阻击，才没让大蛇丸得逞。这次造成的损失更大，折损的都是云隐的军事骨干，连二尾人柱力都被打成了重伤，雷影气得将房子都掀了。自此以后，整个云隐谈蛇色变，综合实力只剩下原来的一半，再也无力向其他四国挑衅。就这样，忍界平平安安地过了三年，除了雷之国其他国家没有爆发大的战争。雷影不是没想过去找大蛇丸报复，可是大蛇丸的蛇窟太多，又非常隐蔽，根本找不到人，况且派去的人如果不够影级，只能被大蛇丸虐。
雷影也几次派使者去木叶问罪，五代火影纲手直接给挡了回去，“大蛇丸已经是叛忍，如果云隐能够将他除去，我们也可以理解。如果能抓住大蛇丸，将他交给我们木叶，那再好也没有了，我们会万分感激的。”雷影得到这样的答复，大发雷霆，却也无可奈何。不得已的情况下，雷影只好让奇拉比躲起来修行，禁止他离开村子。又在附近加派了很多的人手，暗中保护奇拉比。奇拉比虽然不高兴，但由于是大哥的命令，也只好服从。
经过这三次战役，三忍的威名再次震动忍界，大蛇丸名噪天下，很多人都认为大蛇丸已经超过了他的老师猿飞日斩。只有猿飞听到这个说法后，黯然不语，心里充满了伤痛。晶臧叹气，“在猿飞大人心目中，大蛇丸永远是他最喜欢，也是最有能力继承衣钵的弟子。只可惜……”白悄悄递上精心做好的食物，又低声说起一些趣事，希望能缓解猿飞的心情。君麻吕却非常气愤，“猿飞大人对大蛇丸恩重如山，大蛇丸却背叛了自己的师父，这是绝对不可以原谅的！”