与此同时，火箭队一行人也出现在森林中。
“好美的景色，路边的野花一夜之间都开放了呢，有种梦幻的感觉，这种美丽的景色最能打动少女的心了。”武藏有些犯花痴的说着。
“是吗？我可是不太喜欢啊，都快得花粉过敏症了。”一旁的小次郎揉着鼻子满不在乎的说着，换来的当然是武藏的嘲讽，说他一点情调都没有。
喵喵在一旁制止了两人的争吵，一行人边走边再次策划者抢夺皮卡丘的计划，想要趁着夜色发动突然袭击。
就在这时，草丛中传来了窸窸窣窣的声音，一群妙蛙种子捆着一只妙蛙草出现在火箭队面前。双方打了个照面，似乎都有些惊讶，在大眼瞪小眼的看着对方。
“哇！这个地方居然会发现妙蛙种子和妙蛙草哎喵！好多啊！一共有只呀！快抓起来一起献给老大啊喵！”反应过来后，喵喵兴奋的喊道，一行人不管三七二十一冲向了妙蛙种子。
妙蛙种子发现有人突然袭击，集体使出了藤鞭，还没等火箭队近身就把他们抽飞出去。
“我们的出场结束了么？可我们还什么都没干啊！好讨厌的感觉啊！我要把你们一网打尽。”飞在空中的火箭队抱怨道，声音越来越小，飞向了远方。
另一边，小智等人顺着空中飘浮的花粉，不断追逐着妙蛙种子的踪迹，就在他们赶路的时候，森林突然像活了一样，四周的藤蔓都在不停地生长。
“这些藤蔓...不好，大家快跑，前面的路要封闭了！”看见疯长的藤蔓，小智等人奔跑起来，终于在藤蔓封闭道路的一瞬间，冲出了包围。
“原来如此，难怪没有人见过不可思议花园。”小智喃喃的说着。随即跟小刚和小霞解释了不可思议花园的事情，一行人继续向前走去。
没走多远，小智他们就来到了一片宽阔的草地，草地的中央有一棵巨树，不过看起来已经没有了生命力，草地上聚集了大批的妙蛙种子和妙蛙草。
“哇！这就是妙蛙种子的不可思议花园啊！太神奇了！”看着眼前的景色，小智一行人感叹道。
就在这时，草地上的妙蛙种子鸣叫着，空中也飘荡起大量的花粉，所有的花粉都飘向了草地中央的巨树，巨树又焕发的生机，光秃秃的树干上又开满了花朵，空旷的草地上也盛开了大量的鲜花。
“好棒啊！这也太神奇了！真漂亮！”小智等人被眼前的景色惊呆了。
就在这时，巨树的树洞中发出了耀眼的光芒，一直巨大的神奇宝贝缓缓的走了出来，是一只体型健硕的妙蛙花，它径直走到草地中央，发出阵阵的嘶吼。
“是妙蛙花啊！体型好大啊！”小智惊讶的说到，随即拿出自己的图鉴记录着，“妙蛙花，种子神奇宝贝，是妙蛙草的进化形，经常在有阳光的地方定住不动，有人猜测它是在进行光合作用。吸取阳光以便获取能量。”
“光合作用么？那么妙蛙花就是植物喽。”小霞如有所思的说着。
“小智，先找找你的妙蛙草吧，他脑袋上有个绷带，应该挺好发现的。”小刚说到，小智点点头，立即开始寻找，在皮卡丘的帮助下，果然草地的边缘发现了一脸茫然，正东张西望的妙蛙草。但意识到自己是不请自来的客人，小智等人还是决定在一旁观望。
果然在妙蛙花的带领下，所有的妙蛙种子都开始叫了起来，空中飘浮的花粉也纷纷落下，进化的盛典开始了。一个又一个的妙蛙种子开始闪烁着光芒，进化成了妙蛙草。
“这就是进化的仪式吧，好神奇啊。”小霞感叹着。
“对于妙蛙种子是植物还是生物这件事，从以前到现在都有争论，不过可以肯定的是不管是本体还是背上的植物，少了任何一方，妙蛙种子都无法维持生命，大家都是彼此依赖对方，它们就像是这个星球上所有生命的象征呢。”小刚在一旁发出了感叹。
“可是，我的妙蛙草还是没能进化呢。”不像小霞他们二人，小智一直关注着自己的妙蛙草，发现它还是没能顺利完成进化，背上的花骨朵还是在一闪一闪的。“为什么呢，难道它还是克制进化么？”小智也有点搞不懂了。
作为全场唯一一只没有进化的神奇宝贝，妙蛙草的状况引起了妙蛙花的注意，它一步步走向了小智的妙蛙草。其他进化完成的妙蛙草也都注视着小智的妙蛙草，似乎很是不解。
妙蛙花和妙蛙草一句一句的交谈着，不知道在说着什么。突然妙蛙花似乎生气了，使出了藤鞭绝招，小智见状飞奔过去，一把推开了妙蛙草，藤鞭击中草地，留下两条深深的沟壑。
正在小智准备向妙蛙花解释的时候，明亮的月光似乎被什么东西遮挡住了。空中传来了说话的声音，“人生不需要走的太急躁，多绕点路还是有收获的。”一个喵喵形状的热气球出现在空中。
“这究竟是什么啊？”小霞下意识的问到。
“既然你诚心诚意的发问了，我就大发慈悲的告诉你。”
“为了防止世界被破坏，为了守护世界的和平。”
“贯彻爱与真实的邪恶，可爱又迷人的反派角色。”
“武藏，小次郎。”
“我们是穿梭在银河的火箭队二人组。”
“白洞，白色的明天在等着我们。”
“就是这样，喵”
“又是你们！火箭队！你又要在搞什么啊！”小霞发现来的是“熟人”，气愤的说着。
“啊哈哈哈！搞什么？当然是接收这些妙蛙草和妙蛙花喽，小次郎，开始行动！”武藏放肆的笑着，支使小次郎作战。小次郎按下了一个按钮，在他们的热气球的下方出现了一个仪器，超强的风将草地上的神奇宝贝都吸到了机器中，地面乱作一团。
“大丰收！大丰收！统统收进来吧！”不一会，地上的妙蛙草大部分都被吸进了机器中。
就在这时，妙蛙花使出了藤鞭，抓住了飞在空中动弹不得的妙蛙草们，和机器做起了角力。
火箭队见状加大了机器的吸力，妙蛙花招架不住哦，藤鞭松开了，现在除了小智的妙蛙草所有的妙蛙草都被吸了进去。
“就剩小鬼头的一直妙蛙草了哎，算了，也不少这一只，这次就饶了你们了！再见喽！”火箭队正准备心满意足的离开，这可气坏了小智的妙蛙草，朝着天空大声的吼叫着。
小智本想让皮卡丘使用十万伏特，又怕伤害到机器里的神奇宝贝，正犹豫不决的时候，妙蛙草跳了出来，背上的花骨朵聚集着力量。
“好！去吧！妙蛙草！使出阳光烈焰。”小智随即下令攻击。妙蛙草积蓄的力量瞬间爆发，一道巨大的光束直冲而去，准确命中火箭队的热气球，然后妙蛙草又使出了飞叶快刀，割破了关着妙蛙草们的网兜，所有的神奇宝贝都被救了下来。火箭队也从空中掉落在草地上，在一一众妙蛙草愤怒的藤鞭攻击下，一句“好讨厌的感觉”回荡在天际。
“太棒了！干的漂亮妙蛙草！这是！？”就在小智准备上前夸奖自己的神奇宝贝的时候，妙蛙草的身体爆发出耀眼的光芒，背上的花骨朵盛开来，一朵巨大的花朵出现在众人面前，妙蛙草进化成妙蛙花了！小智也不清楚为什么妙蛙草突然想通要进化了，也许它打败了强敌，证明了自己的实力。
进化后的妙蛙花向着天空怒吼，草地上的神奇宝贝们也随声附和，场地中央的妙蛙花也认可了小智妙蛙花的实力，点了点头，用藤鞭和小智的妙蛙花握了握手，转身走进了巨树的树洞。
经历了一夜的风波，小智等人见识到了只有一夜的进化庆典，神奇宝贝的世界有太多的神秘需要发现，未来迎接他们的又会是什么呢？恐怕只有他们自己才能知道吧。